Foça Tıp Fakültesi, Bosna-Hersek'in ilk yükseköğretim kurumu olarak 1944 yılında kurulmuştur. Ancak 1992 yılında Sırp Cumhuriyeti'nin kurulmasıyla birlikte fakülte Sırp Cumhuriyeti'nin yönetimine geçmiştir. Daha sonra 1993 yılında Sırp Cumhuriyeti Saraybosna Üniversitesi kurulmuş ve Tıp Fakültesi de bu üniversiteye dahil edilerek merkezi Foça'ya taşınmıştır. Üniversitenin adı da Doğu Saraybosna Üniversitesi olarak değiştirilmiştir. Bugün Foça Tıp Fakültesi, Doğu Saraybosna Üniversitesi bünyesinde Saraybosna Tıp Fakültesi geleneğini sürdürmektedir.
Foça Tıp Fakültesi, 1993/94 akademik yılında ilk öğrencilerin kaydolmasıyla düzenli derslere başlamıştır. 2000/01 akademik yılında ise lisansüstü düzeyde Biyomedikal Araştırmanın Temelleri adlı bir program başlatılmış ve ikinci eğitim döngüsüne geçilmiştir.
2007 yılında Tıp Fakültesi, Bologna Deklarasyonu'na uygun olarak yeni bir müfredat uygulamaya başlamıştır. Aynı yıl, Tıp Fakültesi tüzel kişilik olarak sona ermiş ve Doğu Saraybosna Üniversitesi'ne bağlı bir birim olarak faaliyetlerine devam etmiştir. Tıp Fakültesi bünyesindeki Diş Hekimliği Fakültesi ise 2008 yılında Tıp Fakültesi'nin öğrenim programına dahil olmuştur.
Foça Tıp Fakültesi, tıp, diş hekimliği, hemşirelik, özel eğitim ve rehabilitasyon gibi alanlarda eğitim programları sunmaktadır. Lisansüstü düzeyde ise biyomedikal bilim ve özel eğitim ve rehabilitasyon programları bulunmaktadır.
Fakülte, mezun ettiği öğrencilerin sayısıyla birlikte uzmanlık programlarına da sahiptir. Tıp ve diş hekimliği alanında uzmanlık unvanı kazanan birçok mezunu bulunmaktadır. Ayrıca fakülte, biyomedikal araştırmaları desteklemek amacıyla bir araştırma merkezi kurmuştur.
Foça Tıp Fakültesi, bugüne kadar birçok öğrenci mezun etmiş ve yüksek lisans ve doktora tezlerine ev sahipliği yapmıştır.